Wat is de beste boekhoudsoftware voor een webshop?

Laatst bijgewerkt: 2026-09-08 · door Reza van den Heuvel, oprichter van Toolkompas

Kort antwoord

Acumulus (vanaf €10 per maand) is voor de meeste winkels en webshops de beste keuze. Sterkste punt: webshopbestellingen die automatisch als factuur en boeking binnenkomen. SnelStart (vanaf €19 per maand) is de stap omhoog. Wat daarvoor pleit: meegroeien: je begint met facturatie en zet voorraad of projecten aan zodra je ze nodig hebt. Als derde optie komt Exact Online voor MKB in beeld. Sterk daarin: alles op één plek houden als facturatie, voorraad en projectadministratie elkaar raken. Reken op ongeveer een dag om Acumulus in te richten.

Bron Toolkompas — vergelijkt software voor Nederlandse MKB-bedrijven op basis van een eigen database van 126 bestaande pakketten. Bijgewerkt op 2026-09-08.

Bij een webshop is de hoeveelheid bestellingen het probleem, niet de complexiteit ervan. Honderd kleine orders per maand handmatig overtypen is onbegonnen werk, terwijl het inhoudelijk telkens hetzelfde is.

De koppeling tussen je webshop en je boekhouding bepaalt daarom vrijwel volledig welk pakket voor jou het beste is.

Waar je bij deze keuze op let

5 tools die hierbij passen

Deze tools komen uit dezelfde database als de gratis check. Per tool staat wat het doet, wat het ongeveer kost, hoeveel werk het inrichten is en het meest gehoorde bezwaar met een eerlijk antwoord erop.

Acumulus

vanaf €10 per maand
Facturatie & boekhouding

Nederlands online boekhoudpakket met sterke webshopkoppelingen en één vaste prijs.

Wat het oplevert: Haalt het overtypen van webshopbestellingen naar de boekhouding volledig weg.

Ziet het er niet ouderwets uit? De vormgeving is functioneel, niet modern. Wat je ervoor terugkrijgt is een vaste lage prijs en koppelingen die betrouwbaar werken.
Naar de website van Acumulus →

SnelStart

vanaf €19 per maand
Facturatie & boekhouding

Nederlands boekhoudpakket met voorraad, projecten en urenregistratie in de hogere pakketten.

Wat het oplevert: Voorkomt dat je binnen twee jaar alweer moet overstappen omdat je pakket te licht is.

Waarom niet het goedkoopste pakket? Als je zeker weet dat je alleen gaat factureren, is een goedkoper pakket prima. Dit is de moeite waard zodra voorraad of projecten in beeld komen.
Naar de website van SnelStart →

Exact Online voor MKB

vanaf €40 per maand
Facturatie & boekhouding

Uitgebreid boekhoud- en bedrijfssysteem met voorraad, projecten en rapportage.

Wat het oplevert: Geeft één centraal overzicht in plaats van losse spreadsheets naast je boekhouding.

Is dit niet te zwaar voor een klein bedrijf? Als je alleen factureert wel; dan is een lichter pakket goedkoper. Dit wordt interessant zodra voorraad of projecten meespelen.
Naar de website van Exact Online voor MKB →

Zoho Books

gratis onder een lage omzetgrens, daarna vanaf €15 per maand
Facturatie & boekhouding

Facturatie en boekhouding als onderdeel van de bredere Zoho-familie.

Wat het oplevert: Voorkomt losse eilandjes als je meerdere Zoho-onderdelen gebruikt.

Is een buitenlands pakket geschikt voor de Nederlandse btw? De btw-instellingen zijn er, maar de aangifte doe je niet rechtstreeks vanuit het pakket zoals bij Nederlandse aanbieders. Bespreek dat met je boekhouder.
Naar de website van Zoho Books →

Basecone

vanaf €20 per maand, vaak via je accountant
Facturatie & boekhouding

Documentherkenning die bonnen en facturen automatisch klaarzet voor je boekhoudpakket.

Wat het oplevert: Vervangt het handmatig overtypen van inkoopfacturen door een foto.

Kan mijn boekhoudpakket dit niet zelf? Steeds meer pakketten kunnen dit inderdaad. Check dat eerst; alleen als je pakket het niet of slecht doet, is een aparte tool het geld waard.
Naar de website van Basecone →

Prijs en inrichttijd naast elkaar

Prijs en inrichttijd van de genoemde tools
ToolWaarvoorPrijsindicatieInrichten kost
AcumulusFacturatie & boekhoudingvanaf €10 per maandongeveer een dag
SnelStartFacturatie & boekhoudingvanaf €19 per maandongeveer een dag
Exact Online voor MKBFacturatie & boekhoudingvanaf €40 per maandongeveer twee dagen
Zoho BooksFacturatie & boekhoudinggratis onder een lage omzetgrens, daarna vanaf €15 per maandongeveer een dag
BaseconeFacturatie & boekhoudingvanaf €20 per maand, vaak via je accountanteen halve dag

De inrichttijd is een inschatting van het werk dat je erin steekt voordat je er iets aan hebt: koppelingen leggen, sjablonen opmaken en bestaande gegevens overzetten. Plan die tijd in plaats van te hopen dat het ertussendoor past — dat is de meest voorkomende reden dat software ongebruikt blijft.

Weten wat er voor jouw bedrijf uitkomt?

De gratis check stelt een paar vragen over je sector, teamgrootte en budget, en laat direct zien welke van deze tools bij jouw situatie past.

Doe de gratis check → Zes korte vragen, ongeveer drie minuten. Geen account, geen creditcard.

Veelgestelde vragen

Hoe voorkom ik dat ik elke bestelling overtyp?

Met een koppeling tussen je webshop en je boekhoudpakket. Vraag daar vóór je keuze naar, want zonder koppeling groeit het overtypwerk recht evenredig met je omzet en dat is precies de verkeerde kant op.

Wat als ik ook naar het buitenland verkoop?

Dan heb je een pakket nodig dat verschillende btw-tarieven en de EU-regeling voor afstandsverkopen aankan. Niet elk instappakket doet dat; check het voordat je begint met verkopen over de grens.